Степени инбридинга кошек

Степени инбридинга кошек.

Перед заводчиком всегда стоят две основные задачи: усовершенствовать те или иные породные признаки своих животных и добиться стабильной передачи этих признаков из поколения в поколение. На разных этапах развития породы, да и самого питомника, на первый план выходит то одна, то другая задача, но по своей важности они равноценны. Стабильность передачи признаков требует создания устойчивых, нерасщепляющихся генных комплексов, то есть преимущественно гомозиготного состояния входящих в них аллелей . А добиться такой гомозиготности можно, лишь применяя близкородственные спаривания — инбридинг.
Но какой тип инбридинга выбрать, на какую его степень (близость) ориентироваться, — этот вопрос заводчик должен решать в зависимости от имеющихся в питомнике животных, от их породных качеств и генетического потенциала и исходя из поставленной задачи: например, поскорее закрепить ценный признак или редкий окрас, добиться однотипности потомства по ряду показателей и т.п

Чистопородное разведение подразделяется на два типа: АУТБРИДИНГ- система неродственных спариваний животных внутри породы, и ИНБРИДИНГ- система спариваний особей, имеющих близкую степень родства, типа брат-сестра, отец-дочь, мать-сын, двоюродные братья и сестры, и т.д. В общем виде инбридинг предполагает, что спариваемые особи- будущие отец и мать -имеют общих предков или хотя бы одного общего предка. Хотя для специалистов важность и необходимость инбридинга в чистопородном разведении очевидны, среди любителей существует масса мифов и предубеждений, причем как против самого инбридинга, так и против использования инбредных производителей в разведении. Последнее- особенно большая ошибка, так как инбридированные отборные производители являются, как правило, препотентными- их дети получаются в основном «в отца», -а также часто дают исключительно сильное потомство.

Спаривание троюродных братьев и сестер (общий прадед) приводит к возрастанию гомозиготности лишь на 2% при бесконечном числе поколений. Следовательно, инбридинг подобного типа уже принципиально отличен от более тесных степеней инбридинга и по сути не ведет к достижению тех целей, которые ставятся перед системой родственных спариваний.

Метод определения инбридинга

Самый доступный метод определения инбридинга животных предложен А. Шапоружем. По его методу можно установить, в каких рядах есть общий предок.

За первый ряд принимают — отец и мать,

за второй – дедов и бабок,

за третий – прадедов и прабабок и т. д.

Запись производится римскими цифрами, первой цифрой указывать ряд, в котором присутствует общий предок по отцовской части родословной и после тире – ряд, в котором встречается общий предок по материнской линии. Если ряды предков повторяющихся в родословной встречаются в какой-либо одной, отцовской или материнской стороне родословной, то цифры разделяют запятыми.

Степени инбридинга (по классификации А. Шапоруж):

1. Тесный инбридинг: вяжут животных находящихся в очень близком родстве.

Отец с дочерью (II – I)

Мать с сыном (I – II)

Родные брат с сестрой (II – II)

2. Близкий инбридинг: спаривание животных, у которых один и тот же предок находится в первых рядах родословной.

Внучка и дед (III-I)

Бабка с внуком (I-III)

Неполные брат с сестрой (II-II)

Племянник с теткой (III-II)

Племянница с дядей (II-III)

3. Умеренный инбридинг – проводится в следующих степенях III-III, III-IV, IV-III, IV-IV.

4. Отдаленный инбридинг – когда общий предок встречается в поколениях V-V, IV-V, V-IV, III-V, V-III. Если общий предок встречается дальше пятого колена, животные считаются практически неродственными.

5. Инбридинг, при котором в родословной потомства имеется пара или несколько общих предков называют комплексным.

Виды инбридинга и цели его применения:

1. Тесный инбридинг

(отец х дочь; мать х сын) – бывает необходимым при закладке линий, для консолидации и «закрепления» генов выдающегося предка. В отдельных случаях, имея уникальных по своей ценности животных, которым невозможно найти достойных партнеров, вынужденно спаривают их с близкими родственниками, чтобы сохранить их генотип и ценные признаки, которыми обладает этот тип.

Такая необходимость возникает на начальных этапах выведения новых пород, а также иногда в случаях разведения по линиям, когда стремятся получить что-то новое при чистопородном разведении, не прибегая к использованию животных других пород.

К близкому инбридингу прибегают также для проверки отдельной линии или конкретных производителей на носительство наследственных аномалий. Тесный и близкий инбридинг не рекомендуется использовать постоянно на одних и тех

же животных, так как сильнее всего инбридинг действует на, те признаки, которые связаны с воспроизводительными способностями, репродуктивной функцией и жизнеспособностью. Необходимо отметить, что эти признаки слабо наследуются, поэтому инбредных животных желательно спаривать с животными других линий или проводить «освежение крови», а затем подбирать пару с учетом умеренного инбридинга.

Бэкросс

представитель каждого поколения скрещивается с начала с одним из родителей, а затем — с одним из потомков, полученным от предыдущего скрещивания.

Сибкросс

в каждом поколения скрещиваются брат и сестра. Оба этих метода направлены прежде всего на закрепление свойств предковой пары кошек. Для проведения таких скрещиваний оба предка должны не только обладать теми замечательными качествами, которые были описаны выше, но и давать однородное потомство.

2. Умеренный инбридинг

применяется для закрепления наследственности выдающихся животных. Общий предок встречается в третьем и четвертом поколениях. Например, при варианте 1V-1V гомозиготность возрастает всего на 0,78% и, разумеется, это не может как-то заметно влиять на фенотип и генотип. Отдаленный инбридинг оказывает небольшое влияние на повышение гомозиготности потомков и мало чем отличается от неродственного спаривания (аутбридинга).

Наиболее распространены нерегулярные системы разведения — линейная и так называемая «закрытая».

Линейная — Линейное разведение, или лайнбридинг – разведение по линиям определённых производителей, которые повторяются в родословной через 2-3 колена (вязка полубрута с полусестрой или кузенов). Иногда такой метод даёт устойчивые результаты.

Закрытая — применяется в сочетании с тщательным подбором производителей. При такой системе в «закрытом питомнике» одновременно содержатся 1-3 кота-производителя и некоторое число самок — от 3 до 10. Из потомства первоначальных пар отбирают лучших представителей, худших из родителей выбраковывают, заменяя лучшими из потомков, и формируют пары второго этапа. С каждым новым поколением эти операции повторяются, причем животные из других питомников в разведении не используются, а количество самцов и самок, используемых в качестве производителей, остается неизменным

Система улучшающих спариваний используется в тех случаях, когда в питомнике первоначально содержится 2-4 посредственных самки и один высококлассный производитель. Начальный этап этой системы (грединг) похож на бэкросс — из полученного от данных пар потомства отбирают лучших дочерей и спаривают с отцом. Однако, в отличие от системы бэкросса, в следующем поколении опять-таки отбирают лучших самок и вновь спаривают с тем же производителем. На следующем этапе (апгрединг) — из потомков отбирают самца, превосходящего своими качествами первого, и спаривают его по той же схеме. Требования к улучшателю те же, что и к родоначальнику линии, плюс к тому желательно инбредное происхождение.

Инбридинг как компонента чистопородного разведения

В процессе своей работы заводчик-селекционер должен решать, каких самок с какими из отборных самцов следует спаривать, чтобы их потомство сочетало определенные признаки и приобретало улучшенные черты. Это селекционное мероприятие называется подбором пар для скрещиваний. Подбор пар должен производиться планомерно и систематически, и цель его изменение генетической структуры популяции животных данного питомника в желательном направлении или сохранение и закрепление в потомстве определенного сочетания ценных признаков. Иногда для выведения новых пород или привнесения в породу совсем новых признаков, ранее ей не свойственных, применяется межпородное или даже межвидовое скрещивание, но обычно основным направлением работы селекционера является так называемое чистопородное разведение — спаривание особей одной породы.

Статья по теме Чистопородные кошки: медицинские, породные и генетические аспекты

Чистопородное разведение подразделяется на два типа: аутбридинг — система неродственных спариваний животных внутри породы, и инбридинг — система спариваний особей, имеющих близкую степень родства, типа брат-сестра, отец-дочь, мать-сын, двоюродные братья и сестры, и т.д. В общем виде инбридинг предполагает, что спариваемые особи — будущие отец и мать — имеют общих предков или хотя бы одного общего предка. Хотя для специалистов важность и необходимость инбридинга в чистопородном разведении очевидны, среди любителей существует масса мифов и предубеждений, причем как против самого инбридинга, так и против использования инбредных производителей в разведении. (Заранее скажем, что последнее особенно большая ошибка, так как инбридированные отборные производители являются, как правило, препотентными — их дети получаются в основном «в отца», — а также часто дают исключительно сильное потомство.)

Инбридинг кошек: польза и вред

ИНБРИДИНГ

Перед заводчиком всегда стоят две основные задачи: усовершенствоват ь те или иные породные признаки своих животных и добиться стабильной передачи этих признаков из поколения в поколение. В процессе работы приходится решать, каких кошек с какими котами следует спаривать, чтобы их потомство сочетало определенные признаки и приобретало улучшенные черты. Способы подбора производителей по их генотипическим особенностям и здоровью называют методом разведения

. Существуют два основных метода разведения животных:

Межвидовое, межпородное скрещивание

. Применяется для выведения новых пород или привнесения в породу новых, ранее не свойственных, признаков;

Чистопородное

. Осуществляется спариванием животных одной породы. Применяется для сохранения и поддержания породы на определенном уровне, а также для ее совершенствовани я. Этот метод разведения подразделяется на два типа:

Аутбридинг – спаривание не родственных животных внутри породы. Иногда такое разведение «размывает» желательный тип, и в результате потомство не повторяет ни отца, ни матери. Однако, иногда такие вязки наоборот способны сочетать в потомстве самые лучшие качества каждой линии отца и матери.

Родственное разведение . Осуществляется путем однократного, либо повторного спаривания более или менее близкородственны х между собой животных.

В задачи заводчика входит:

— Усовершенствован ие типа родителей.

— Закрепление полученных результатов в однородности помета.

— Сохранение стабильности полученных результатов.

Для того чтобы создать в породе более устойчивую наследственность или сохранить и усилить в потомстве наследственные качества выдающегося предка, заводчики используют родственное разведение – инбридинг

, то есть спаривание близких родственников (отец-дочь, мать-сын, брат-сестра).

В чем же заключается сущность инбридинга, и каким образом инбредное разведение помогает заводчику добиться необходимых результатов?

Известно, что в результате многих лет эволюции, все современные породы животных , включая и кошек, являются гетерозиготными по многим генам. Например, фенотипически абсолютно черный кот может нести в своем генотипе ген, определяющий гималайский окрас (ген c s ). Рассмотрим результаты инбредной вязки такого кота с его сестрой – гетерозиготной черной кошкой, также несущей ген, гималайского окраса. В потомстве указанных кошек будет наблюдаться расщепление

: часть потомства будет иметь черный окрас ( CC — гомозиготный, Cc s – гетерозиготный генотипы), а другая часть – гималайский окрас ( c s c s ).

Как видно из рисунка, расщепление объясняется тем, что при скрещивании рассматриваемых кошки и кота, их половые гаметы, несущие по одинарному набору генов, будут встречаться во всех четырех возможных комбинациях. В результате с одинаковой вероятностью — 1/4 , в помете образуется оба гомозиготных генотипа: котята черного и гималайского окрасов.

Иными словами, гены, находящиеся в гетерозиготном состоянии, при инбридинге переходят в гомозиготное состояние, в результате чего, в следующем поколении (при скрещивании гомозиготных организмов одного окраса) уже не будет наблюдаться расщепления. А именно создание устойчивых, нерасщепляющихся комплексов и способно обеспечить стабильность передачи признаков.

На основании вышесказанного можно сделать следующие краткие выводы:

Инбридинг
— (англ, inbreeding, от in — и, внутри и breeding — разведение), это близкородственно е скрещивание, т.е. скрещивание особей имеющих общих предков. Общность происхождения скрещиваемых организмов увеличивает вероятность наличия у них одних и тех же аллелей любых генов, поэтому вероятность появления гомозиготных организмов возрастает с повышением степени родства;
С помощью инбридинга осуществляется выявление скрытых признаков, закрепление желательных признаков в поколениях (тип, редкий окрас, и прочее), и создание устойчивых генетических линий.

Определение степени инбридинга:

Самый доступный метод определения инбридинга животных предложен А. Шапоружем. По его методу можно установить, в каких рядах есть общий предок.

За первый ряд принимаются – отец и мать,

за второй – дедов и бабок,

за третий – прадедов и прабабок и т. д.

Запись производится римскими цифрами, первой цифрой указывается ряд, в котором присутствует общий предок по отцовской части родословной и после тире – ряд, в котором встречается общий предок по материнской линии. Если ряды предков повторяющихся в родословной встречаются в какой-либо одной, отцовской или материнской стороне родословной, то цифры разделяют запятыми.

Рассмотрим различные степени инбридинга.

Степени инбридинга (по классификации А. Шапоруж):

ЧТО НУЖНО ЗНАТЬ ОБ ИНБРИДИНГЕ И ПРИБЫЛЬНОСТИ

ЧТО НУЖНО ЗНАТЬ ОБ ИНБРИДИНГЕ И ПРИБЫЛЬНОСТИ

ВВЕДЕНИЕ

Концепция инбридинга в молочном животноводстве широко обсуждалась в течение многих лет. У большинства производителей все еще есть достаточно вопросов о допустимом уровне инбридинга на их фермах, чтобы продолжать генетический прогресс, но не вызывать никакого негативного снижения продуктивности, фертильности или показателей здоровья. Часто увеличение инбридинга считается очень негативным фактором и его следует избегать. В недавней статье издания Journal of Dairy Science было заявлено: «Важно отметить, что сам по себе инбридинг не является ни хорошим, ни плохим. При отборе для улучшения того или иного признака (в большинстве случаев мы заинтересованы в повышении продуктивности конкретного производственного признака) накопление гомозиготности при благоприятных вариантах является основной целью» (Maltecca et al. 2020). Сам по себе инбридинг не является фактором, который должен влиять на решения отбора. Нам нужно понять, как инбридинг влияет на рентабельность животного, а также на решение о подборе пар, чтобы мы сосредоточились на генетическом прогрессе и, в конечном итоге, на прибыльности.

Геномный инбридинг (gIB) может быть идентифицирован для всех животных, прошедших геномное тестирование, с помощью оценки США (рис. 1А). gIB — это относительный процент гомозиготных аллелей, которые животное имеет в составе своей ДНК. Если число положительное, это означает, что у животного более высокий процент одинаковых аллелей в одном месте, чем в общей популяции. Процент гомозиготности означает долю генома, в котором присутствует один и тот же вариант. Если каждая локация имеет два варианта, B или b, гомозиготной комбинацией будет bb или BB. Гетерозиготной комбинацией будет Bb (рис. 2). Геномный инбридинг более точен, чем инбридинг по родословной (по прародителям), потому что с помощью геномики мы точно знаем, какие аллели были переданы от каждого родителя и где происходит фактический инбридинг (гомозиготность).

Рисунок 1

Рисунок 2

На рис. 3 показан результат закрепления одной коровы с четырьмя полнородными братьями: DELTA, DENVER, DRAMA и DION, чтобы продемонстрировать разницу в инбридинге по родословной и в геномном инбридинге. Инбридинг потомства по родословной, созданный путем скрещивания одной и той же коровы с каждым из четырех братьев, составляет 11,5%. Инбридинг потомства по родословной тот же самый для потомства четырех братьев, потому что инбридинг по родословной вычисляет родословные отношения отца и матери, основанные на общем происхождении. Поскольку каждый из этих быков имеет одинаковую информацию о происхождении, они имеют одинаковые родословные по отношению к указанной корове. Геномный инбридинг потомства от каждого из этих быков очень отличается. Ожидается, что потомство быка DELTA будет иметь геномный инбридинг на 7% выше, чем потомство быка DRAMA. Каждый бык в этом примере не унаследовал одни и те же гены от своих родителей, поэтому каждый бык имеет различные геномные отношения с этой самкой или геномный инбридинг их ожидаемого потомства. Наиболее точным представлением инбридинга является геномный инбридинг, поскольку он использует информацию SNP для вычисления доли гомозиготного генома.

Рисунок 3

ЧТО ТАКОЕ ОЖИДАЕМЫЙ БУДУЩИЙ ИНБРИДИНГ (EFI)?

Ожидаемый будущий инбридинг (EFI) — это предполагаемый будущий уровень инбридинга потомков животного при скрещивании с общей популяцией.

Основная популяция, используемая CDCB — это самки, родившиеся за последние четыре года, имеющие информацию о родословной в CDCB. EFI отображается в информации об оценке в США и основывается на среднем по родословной отношении особи к основной популяции (рис. 1С). gEFI также можно найти в информации об оценке в США и он основывается на родстве, которое особь разделяет со средним показателем по породе с учётом геномных исследований (рис. 1B).

КАКОЙ УРОВЕНЬ ИНБРИДИНГА ВЛИЯЕТ НА ПРОГНОЗИРУЕМУЮ ПЕРЕДАЮЩУЮ СПОСОБНОСТЬ (РТА)?

С 2008 года оценки для EFI в США были скорректированы. В мае 2020 года CDCB Connections совместно с техническим консультантом Дуэйном Норманом представил текущие эффекты ожидаемого будущего уровня инбридинга животных (EFI). Министерство сельского хозяйства США оценивает экономическую ценность инбредной депрессии, связанной с каждым 1% инбридинга животного для каждого экономического признака, который показан на рис.4. Например, за каждый 1% инбридинга, которым обладает животное, индекс пожизненной прибыли (NM$) уменьшается на $25. Точно так же молоко уменьшается на 63,9 фунта (28,98 кг) на каждый 1% инбридинга, которым обладает животное. На рис. 5 показан пример того, как инбредная депрессия влияет на оценку NM$ у 4 быков. Каждый из 4 быков имеет одинаковое сырое или нескорректированное значение NM$ в размере 1000 NM$. Каждая из дочерей этих быков выглядит одинаково; однако у каждого быка разные значения EFI от 7% до 10%. В последней колонке показан скорректированный EFI и официальный NM$, который публикуется в оценке быка. Разница между пожизненной прибылью дочерей 1 быка и 4 быка составляет 75 долларов. Скорректированный NM$ определяется путем вычитания EFI, умноженного на 25 долларов США (инбредная депрессия за каждый 1% инбридинга в NM$) из нескорректированного значения NM$.

Рисунок 4

Рисунок 5

НА ЧТО ВЛИЯЕТ ИНБРИДИНГ: НА ПРОИЗВОДИТЕЛЬНОСТЬ ИЛИ ПРИБЫЛЬНОСТЬ?

Геномный инбридинг (gIB) влияет на производительность или прибыльность. EFI оценивает, каким был бы уровень инбридинга потомков особи, если бы они были скрещены с общей популяцией. gIB указывает на фактический инбридинг особи от генов, переданных их отцом и матерью.

УВЕЛИЧИЛСЯ ЛИ ИНБРИДИНГ БЛАГОДАРЯ ГЕНОМНОМУ ТЕСТИРОВАНИЮ?

Первоначально геномное тестирование дало молочной промышленности возможность оценивать генетический потенциал большей группы животных с более высокой точностью, чем это было возможно ранее с помощью средних показателей предков. Эта возможность могла бы привести к большему разнообразию животных, используемых для создания следующего поколения родителей; однако производители также, вероятно, будут использовать высокоточные геномные показатели PTA из геномных оценок, чтобы выбрать наиболее генетически ценного быка или мать для создания ремонтных самок. Это сужает генетический фонд до нескольких избранных особей. Кроме того, геномное тестирование сократило временные рамки, необходимые для определения ценности животного. Это означает, что молодое животное может быть оценено как имеющее высокую генетическую ценность до наступления половозрелого возраста и использоваться в качестве родителя для следующего поколения. Это уменьшает интервал между поколениями или средний возраст животного, когда рождается его замена. CDCB сообщает, что с момента введения геномного тестирования, интервал между поколениями для отцов быков-производителей сократился с 7 до 2,5 лет, а для матерей быков-производителей с 4 до 2,5 лет. За этот же период времени средний инбридинг коров Голштинской породы увеличился с 5,66% в 2010 году до 8,49% в 2021 году и с 6,84% в 2010 году до 8,74% в 2020 году у коров Джерсейской породы (https://queries.uscdcb.com/eval/summary/inbrd.cfm) (рис. 6 и 7). Важно отметить, что геномное тестирование не увеличило количество инбридинга в нашей популяции молочного скота, а наоборот, инбридинг увеличился из-за стратегий, которые используются для отбора быков и матерей на основе геномной информации (Norman 2020). Инбридинг происходит в каждом поколении, и уменьшение интервала между поколениями, а также увеличение интенсивности отбора ускоряют рост инбридинга.

Рисунок 6

Рисунок 7
КАКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ПРОВОДЯТСЯ В НАСТОЯЩЕЕ ВРЕМЯ В ОБЛАСТИ ИНБРИДИНГА МОЛОЧНЫХ КОРОВ?

В настоящее время исследователи работают над выявлением летальных или негативных рецессий. Мы можем идентифицировать 16 из этих негативных рецессивов в тот момент, когда животные получают геномную оценку (Cole et. al, 2018). Мы должны продолжать выявлять области генома, на которые отрицательно влияет повышенная гомозиготность инбридинга, а также области, на которые положительно влияет повышенный инбридинг.

КАК УЧИТЫВАЕТСЯ ИНБРИДИНГ ПРИ ХРОМОСОМНОМ ПОДБОРЕ ПАР®

Целью Программы по Хромосомному подбору пар® не является сокращение инбридинга. Хромосомный подбор пар® выбирает лучшие пары для закрепления для повышения прибыльности, принимая во внимание инбредную депрессию, вызванную инбридингом (IB или gIB) предполагаемого потомства. Формула для определения экономической ценности потомства по сценарию подбора пар выглядит так: генетическая выгода минус инбредная депрессия. Уравнение, которое STgenetics® использует в Программе по Хромосомному подбору пар®, рассчитывает прогнозируемую продуктивную ценность (PPV), которая показывает, как животное будет работать в стаде (Sun et. Al, 2013). Первый шаг формулы удаляет потери EFI из значений PTA отца и матери. На втором этапе определяется фактическое отношение каждой подобранной пары, рассчитанное CDCB.

Это соотношение может быть использовано для прогнозирования уровня инбридинга потомства. На третьем этапе формула соотносит потери от инбридинга предложенного потомства путем умножения инбредной депрессии выбранного признака для оптимизации инбридинга потомства. Хотя максимальное увеличение PPV в Хромосомном подборе пар® не ограничивает инбридинг, оптимизация PPV снижает инбридинг в потомстве от подобранных пар по сравнению с простой оптимизацией для PTA в программе подбора пар. Дополнительные сведения о PPV см. в статье «Прогнозируемая производственная стоимость» (PPV). Что это такое и почему это так важно?!

УКАЗЫВАЕТ ЛИ ВЫСОКИЙ ГЕНОМНЫЙ ИНБРИДИНГ НА НИЗКОЭФФЕКТИВНОЕ ИЛИ МЕНЕЕ ПРИБЫЛЬНОЕ ЖИВОТНОЕ?

Нет, помните, что gIB — это процент гомозиготных аллелей, которые есть у особей в составе их ДНК. Большая гомозиготность означает меньшее разнообразие в генетической структуре, но это не обязательно означает меньшую генетическую ценность. Как уже было сказано во введении, и недавняя статья в Journal of Dairy Science подтвердила: «Важно отметить, что сам по себе инбридинг не является ни хорошим, ни плохим. При отборе для улучшения того или иного признака (в большинстве случаев мы заинтересованы в повышении продуктивности конкретного производственного признака) накопление гомозиготности при благоприятных вариантах является основной целью» (Maltecca et al. 2020).

Геномного инбридинга (gIB) недостаточно для определения производственной ценности животного. Мы также должны сначала посмотреть на генетическую ценность животного, а затем учитывать инбредную депрессию. Дуэйн Норман написал в мае 2021 в материале CDCB Connection: «Инбридинг отрицательно влияет на большинство индивидуальных признаков. Тем не менее, генетические выгоды в результате интенсивного отбора могут превосходить любые потери, понесенные от инбредной депрессии. На рисунке 8 показан пример использования Хромосомного подбора пар® для закрепления одной самки с двумя разными быками, CAPTAIN и SULLY. Ожидается, что потомство CAPTAIN будет иметь более высокое значение инбридинга, выше на 1%, но также прогнозируется, что за свою жизнь оно принесет прибыль на 317 долларов больше, чем потомство Салли. Это подтверждает, что при определении генетической ценности необходимо учитывать дополнительную генетику и инбредную депрессию, и могут возникнуть дополнительные издержки снижения инбридинга вместо увеличения генетической выгоды.

Рисунок 8

Май 2021 CDCB Connection

(https://www.uscdcb.com/wp-content/uploads/2020/05/Microsoft-Word-CDCB-Norman-Inbreeding-05_2020-CDCB-Norman-Inbreeding-05_2020.pdf).

СУЩЕСТВУЕТ ЛИ ОПРЕДЕЛЕННЫЙ КОЭФФИЦИЕНТ ИНБРИДИНГА, КОТОРЫЙ НЕ ДОЛЖЕН БЫТЬ ПРЕВЫШЕН В СТАДЕ?

Исторически в молочном животноводстве приветствовалось сокращение роста инбридинга, либо просто нужно было не превышать произвольный средний уровень инбридинга. До геномного тестирования увеличение гомозиготности у особи или увеличение инбридинга могло привести к экспрессии отрицательных гаплотипов. Например, до того, как мы обнаружили гаплотип голштинского дефицита холестерина (HCD), существовал высокий риск подбора родственных животных, которые оба несли гаплотип HCD, что приводило к появлению у телёнка летального дефицита холестерина. Геномное тестирование позволило нам идентифицировать животных с отрицательными гаплотипами, и теперь молочные производители могут избежать нежелательного подбора с помощью программы по Хромосомному подбору пар®. В настоящее время нет допустимого порога инбридинга, который приводит к катастрофической потере; следовательно, лучшая стратегия управления инбридингом — избегать подбора двух родителей-носителей одного и того же отрицательного гаплотипа и использовать фактический инбридинг для увеличения показателей стада в программе по Хромосомному подбору пар®.

ИСТОЧНИКИ:

Cole, J.B., P.M. VanRaden, D.J. NULL, J.L. Hutchinson, T. A. Cooper, and S. M. Hubbard. 2021. AIP research report Genoimc4:

Haplotype tests for economically important traits of dairy cattle. Accessed May 12, 2021. https://aipl.arsusda.gov/reference/haplotypes_ARR-G4.html

Maltecca, C., Tiezzi, F., Cole, J.B., and Baes, C. 202. Exploiting homozygosity in the era of genomics- selection, inbreeding, and mating programs.

Journal of Dairy Science. doi: 10.3168/jds.2019-17846

Sun, C., Vanraden, P., O’Connell, J.,Weigel, K., and Gianola, D. 2013. Mating programs including genomic relationships and dominance effects.

Journal of Dairy Science. 96:8014–8023. doi:10.3168/jds.2013-6969